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y_uti のブログ

統計、機械学習、自然言語処理などに興味を持つエンジニアの技術ブログです

『言語処理 100 本ノック』に PHP で挑む (問題 78 ~ 79)

『言語処理 100 本ノック』に PHP で挑戦しています。今回は、第 8 章の残りの問題を解いていきます。
www.cl.ecei.tohoku.ac.jp

78. 5分割交差検定

76-77の実験では,学習に用いた事例を評価にも用いたため,正当な評価とは言えない.すなわち,分類器が訓練事例を丸暗記する際の性能を評価しており,モデルの汎化性能を測定していない.そこで,5分割交差検定により,極性分類の正解率,適合率,再現率,F1スコアを求めよ.

まず、交差検定用にファイルを分割するプログラムを実装します。split_feature 関数は入力ファイルを行単位に $n 等分して配列に格納します。PHP には array_chunk 関数が用意されていますが、array_chunk 関数では末尾の要素だけが短くなってしまうので*1、均等に分割できるように自作しています。分割したデータは、train[0-4].txt, test[0-4].txt として一度ファイルに書き出します。

<?php

function split_feature($filename, $n)
{
    $lines = file($filename);

    $splitted = [];
    $limit = 0;
    for ($i = 0; $i < $n; ++$i) {
        $offset = $limit;
        $limit = (int) (count($lines) * ($i + 1) / $n);
        $splitted[] = array_slice($lines, $offset, $limit - $offset);
    }

    return $splitted;
}

function write_splitted_features($splitted)
{
    $n = count($splitted);
    for ($i = 0; $i < $n; ++$i) {
        unlink("train$i.txt");
        for ($j = 0; $j < $n; ++$j) {
            if ($j != $i) {
                file_put_contents("train$i.txt", $splitted[$j], FILE_APPEND);
            }
        }
        file_put_contents("test$i.txt", $splitted[$i]);
    }
}

交差検定を行うプログラムは以下のように実装しました。ロジスティック回帰で train$i.txt を学習し、test$i.txt の極性を予測します。処理の内容は、第 8 章のこれまでの問題で実装してきたものと同様です。

<?php

function train_and_predict($logisticRegression, $i)
{
    $train = read_feature_data("train$i.txt");
    train($logisticRegression, $train, "model$i.txt");

    $test = read_feature_data("test$i.txt");
    predict($logisticRegression, $test, "predict$i.txt");
}

function read_feature_data($filename)
{
    $lines = file($filename, FILE_IGNORE_NEW_LINES);

    $data = [];
    foreach ($lines as $line) {
        $data[] = decode($line);
    }

    return $data;
}

function decode($encoded)
{
    $columns = explode(' ', $encoded);

    $label = $columns[0] == '+1' ? 1 : 0;
    $feature = [];
    for ($i = 1; $i < count($columns); $i += 2) {
        $feature[$columns[$i]] = (int) $columns[$i + 1];
    }

    return [$label, $feature];
}

function train($logisticRegression, $features, $filename)
{
    $logisticRegression->train($features);

    $fh = fopen($filename, 'wb');
    foreach ($logisticRegression->weights as $word => $value) {
        fwrite($fh, "$word $value\n");
    }
    fclose($fh);
}

function predict($logisticRegression, $features, $filename)
{
    $counts = [[0, 0], [0, 0]];

    $fh = fopen($filename, 'wb');
    foreach ($features as list($label, $feature)) {
        $hypothesis = $logisticRegression->hypothesis($feature);
        $predicted = $hypothesis > 0.5 ? 1 : 0;
        $line = ($label ? '+1' : '-1') . "\t" . ($predicted ? '+1' : '-1') . "\t" . $hypothesis;
        fwrite($fh, "$line\n");
        ++$counts[$label][$predicted];
    }
    fclose($fh);

    $tp = $counts[1][1];
    $fp = $counts[0][1];
    $fn = $counts[1][0];
    $tn = $counts[0][0];

    $accuracy = ($tp + $tn) / ($tp + $fp + $fn + $tn);
    $precision = $tp / ($tp + $fp);
    $recall = $tp / ($tp + $fn);
    $f1score = 2 * $precision * $recall / ($precision + $recall);

    echo "Accuracy = $accuracy\n";
    echo "Precision = $precision\n";
    echo "Recall = $recall\n";
    echo "F1 score = $f1score\n";
}

以上の関数を利用して、次のプログラムで 5 分割交差検定を実行します。LogisticRegression.php は問題 73 で実装したものをそのまま利用します。

<?php

require_once __DIR__ . '/LogisticRegression.php';
require_once __DIR__ . '/split_feature.php';
require_once __DIR__ . '/train_and_predict.php';

main();

function main()
{
    $n = 5;
    $splitted = split_feature('feature.txt', $n);
    write_splitted_features($splitted);

    $logisticRegression = new LogisticRegression(1e-4, 1e-2);

    for ($i = 0; $i < 5; ++$i) {
        train_and_predict($logisticRegression, $i);
    }
}

実行結果は以下のとおりです。5 分割交差検定のそれぞれに対して、正解率、適合率、再現率、F1 score を出力しています。

$ php main.php
Accuracy = 0.74390243902439
Precision = 0.73957367933272
Recall = 0.75070555032926
F1 score = 0.74509803921569
Accuracy = 0.72514071294559
Precision = 0.70183486238532
Recall = 0.74561403508772
F1 score = 0.72306238185255
Accuracy = 0.74074074074074
Precision = 0.7447963800905
Recall = 0.75228519195612
F1 score = 0.74852205547976
Accuracy = 0.72983114446529
Precision = 0.72205438066465
Recall = 0.70501474926254
F1 score = 0.7134328358209
Accuracy = 0.74777308954524
Precision = 0.77127172918573
Recall = 0.74535809018568
F1 score = 0.75809352517986

前回の記事に掲載したように、問題 76 では学習したデータそのものを予測して 99% 近い正解率が得られていましたが、今回の結果では 74% 程度の正解率になっています。これは過学習が起きていることが原因だと考えられるので、ロジスティック回帰に正則化項を導入して比較してみます。

問題 73 で実装した LogisticRegression クラスを継承して、L2 正則化を含む形のコスト関数と勾配を実装しました。

<?php

require_once __DIR__ . '/LogisticRegression.php';

class LogisticRegressionL2 extends LogisticRegression
{
    public $penalty;

    public function __construct($rate = 1.0, $threshold = 1e-3, $penalty = 1.0)
    {
        parent::__construct($rate, $threshold);
        $this->penalty = $penalty;
    }

    public function cost()
    {
        $cost = parent::cost();

        $sum = 0;
        foreach ($this->weights as $word => $weight) {
            if ($word != '') {
                $sum += $weight * $weight;
            }
        }

        $cost += $this->penalty * $sum / 2;

        return $cost;
    }

    public function gradient()
    {
        $grad = parent::gradient();

        foreach ($this->weights as $word => $weight) {
            if ($word != '') {
                $grad[$word] += $this->penalty * $weight;
            }
        }

        return $grad;
    }
}

メインプログラムを以下のように書き換えて実行します。

$ diff main.php main_l2.php
3c3
< require_once __DIR__ . '/LogisticRegression.php';
---
> require_once __DIR__ . '/LogisticRegressionL2.php';
15c15
<     $logisticRegression = new LogisticRegression(1e-4, 1e-2);
---
>     $logisticRegression = new LogisticRegressionL2(1e-4, 1e-2, 1.0);

実行結果は以下のとおりです。正解率は少し高くなっているものの、それほど大きな差は見られませんでした。

$ cat result_l2_penalty_1/result.txt
Accuracy = 0.76594746716698
Precision = 0.76014760147601
Recall = 0.77516462841016
F1 score = 0.7675826734979
Accuracy = 0.74108818011257
Precision = 0.71545454545455
Recall = 0.76705653021442
F1 score = 0.74035747883349
Accuracy = 0.75058602906704
Precision = 0.76018518518519
Recall = 0.75045703839122
F1 score = 0.75528978840846
Accuracy = 0.73545966228893
Precision = 0.72359328726555
Recall = 0.72074729596853
F1 score = 0.72216748768473
Accuracy = 0.74964838255977
Precision = 0.77923292797007
Recall = 0.73651635720601
F1 score = 0.75727272727273
79. 適合率-再現率グラフの描画

ロジスティック回帰モデルの分類の閾値を変化させることで,適合率-再現率グラフを描画せよ.

計算結果を CSV ファイルとして出力し、Excel でグラフを作成する方針で進めます。以下のようにプログラムを実装しました。判別結果を確率の降順に整列して、適合率と再現率、F1 スコアを計算していきます。

<?php

main();

function main()
{
    $data = read_predicted_data('predict.txt');
    rsort($data);

    $npos = array_sum(array_column($data, 1));
    $tp = 0;
    foreach ($data as $i => list($probability, $truth)) {
        $tp += $truth;
        $precision = $tp / $i;
        $recall = $tp / $npos;
        $f1score = 2 * $precision * $recall / ($precision + $recall);
        echo implode(',', [$probability, $precision, $recall, $f1score]), "\n";
    }
}

function read_predicted_data($filename)
{
    $data = [];

    $lines = file($filename, FILE_IGNORE_NEW_LINES);
    foreach ($lines as $line) {
        list ($truth, $predicted, $probability) = explode("\t", $line);
        $data[] = [(float) $probability, $truth == '+1' ? 1 : 0];
    }

    return $data;
}

問題 78 の交差検定で得られた結果の一つから描画したグラフを以下に示します。左のグラフは閾値を横軸に取って各指標の値をプロットしたもの、右のグラフが precision-recall 曲線を描いたものです。
 

*1:各 chunk のサイズを指定して分割するので、たとえば 10 要素の配列を 3 要素ずつ分割すると (3, 3, 3, 1) と分割されます。